MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1 chromosome

Total Repeats: 74307

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_008340	TCC	2	6	158116	158121	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114319299
3502	NC_008340	ACC	2	6	158143	158148	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319299
3503	NC_008340	GCC	2	6	158159	158164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319299
3504	NC_008340	CATC	2	8	158267	158274	25 %	25 %	0 %	50 %	114319299
3505	NC_008340	G	6	6	158306	158311	0 %	0 %	100 %	0 %	114319299
3506	NC_008340	G	6	6	158315	158320	0 %	0 %	100 %	0 %	114319299
3507	NC_008340	CTC	2	6	158349	158354	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114319299
3508	NC_008340	GCCG	2	8	158370	158377	0 %	0 %	50 %	50 %	114319299
3509	NC_008340	CCCAG	2	10	158414	158423	20 %	0 %	20 %	60 %	114319299
3510	NC_008340	TGC	2	6	158428	158433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319299
3511	NC_008340	GGC	2	6	158445	158450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319299
3512	NC_008340	GCAGGG	2	12	158474	158485	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	114319299
3513	NC_008340	TCG	2	6	158551	158556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319300
3514	NC_008340	CAG	2	6	158562	158567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319300
3515	NC_008340	GT	3	6	158605	158610	0 %	50 %	50 %	0 %	114319300
3516	NC_008340	CCA	2	6	158615	158620	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319300
3517	NC_008340	CTT	2	6	158745	158750	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114319300
3518	NC_008340	CTT	2	6	158790	158795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114319300
3519	NC_008340	CAG	2	6	158796	158801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319300
3520	NC_008340	CGG	2	6	158835	158840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319300
3521	NC_008340	TCCAC	2	10	158852	158861	20 %	20 %	0 %	60 %	114319300
3522	NC_008340	AGGT	2	8	158947	158954	25 %	25 %	50 %	0 %	114319300
3523	NC_008340	GCG	2	6	159007	159012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319300
3524	NC_008340	GCA	2	6	159020	159025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319300
3525	NC_008340	GGC	2	6	159080	159085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319300
3526	NC_008340	GCA	2	6	159248	159253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319300
3527	NC_008340	CTC	2	6	159267	159272	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114319300
3528	NC_008340	GGT	2	6	159278	159283	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319300
3529	NC_008340	TCG	2	6	159313	159318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319300
3530	NC_008340	CCG	2	6	159319	159324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319300
3531	NC_008340	CCA	3	9	159338	159346	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319300
3532	NC_008340	GGC	2	6	159350	159355	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319300
3533	NC_008340	TCG	2	6	159409	159414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319300
3534	NC_008340	GC	3	6	159419	159424	0 %	0 %	50 %	50 %	114319300
3535	NC_008340	AGG	2	6	159436	159441	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319300
3536	NC_008340	GTC	2	6	159447	159452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319300
3537	NC_008340	TCG	2	6	159520	159525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319300
3538	NC_008340	GTC	2	6	159534	159539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319300
3539	NC_008340	GGCC	2	8	159578	159585	0 %	0 %	50 %	50 %	114319300
3540	NC_008340	CCG	2	6	159616	159621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319300
3541	NC_008340	CCA	2	6	159650	159655	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319300
3542	NC_008340	CGG	2	6	159698	159703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319300
3543	NC_008340	TGC	2	6	159836	159841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319300
3544	NC_008340	CTC	2	6	159873	159878	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114319300
3545	NC_008340	GTA	2	6	159975	159980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319300
3546	NC_008340	GGCGAA	2	12	160044	160055	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	114319300
3547	NC_008340	CTC	2	6	160092	160097	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114319300
3548	NC_008340	GCT	2	6	160238	160243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319300
3549	NC_008340	GAT	2	6	160260	160265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319300
3550	NC_008340	GCC	2	6	160271	160276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319300
3551	NC_008340	GTG	2	6	160302	160307	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319300
3552	NC_008340	GCCC	2	8	160310	160317	0 %	0 %	25 %	75 %	114319300
3553	NC_008340	GGT	2	6	160331	160336	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319300
3554	NC_008340	AGC	2	6	160360	160365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319300
3555	NC_008340	CGGC	2	8	160445	160452	0 %	0 %	50 %	50 %	114319301
3556	NC_008340	CCA	2	6	160499	160504	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319301
3557	NC_008340	CG	3	6	160540	160545	0 %	0 %	50 %	50 %	114319301
3558	NC_008340	CCTCGC	2	12	160547	160558	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	114319301
3559	NC_008340	GCC	2	6	160562	160567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319301
3560	NC_008340	GTC	2	6	160575	160580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319301
3561	NC_008340	GCC	2	6	160671	160676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319301
3562	NC_008340	GC	3	6	160774	160779	0 %	0 %	50 %	50 %	114319301
3563	NC_008340	CCG	2	6	160784	160789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319301
3564	NC_008340	GCC	2	6	160847	160852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319301
3565	NC_008340	CGCT	2	8	160861	160868	0 %	25 %	25 %	50 %	114319301
3566	NC_008340	CACCAG	2	12	160884	160895	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	114319301
3567	NC_008340	GCGG	2	8	160911	160918	0 %	0 %	75 %	25 %	114319301
3568	NC_008340	TCC	2	6	160957	160962	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114319301
3569	NC_008340	CAC	2	6	160998	161003	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319301
3570	NC_008340	CGG	2	6	161056	161061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319301
3571	NC_008340	GGTG	2	8	161072	161079	0 %	25 %	75 %	0 %	114319301
3572	NC_008340	GTG	2	6	161097	161102	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319301
3573	NC_008340	GCT	2	6	161147	161152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319301
3574	NC_008340	CCA	2	6	161177	161182	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319301
3575	NC_008340	GGC	2	6	161195	161200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319301
3576	NC_008340	GCCG	2	8	161280	161287	0 %	0 %	50 %	50 %	114319301
3577	NC_008340	CGG	2	6	161291	161296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319301
3578	NC_008340	GCA	2	6	161357	161362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319301
3579	NC_008340	CAT	2	6	161429	161434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319301
3580	NC_008340	GCTG	2	8	161447	161454	0 %	25 %	50 %	25 %	114319301
3581	NC_008340	TGGCG	2	10	161483	161492	0 %	20 %	60 %	20 %	114319301
3582	NC_008340	CGGC	2	8	161501	161508	0 %	0 %	50 %	50 %	114319301
3583	NC_008340	GCC	2	6	161544	161549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319301
3584	NC_008340	GAT	2	6	161565	161570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319301
3585	NC_008340	CCA	2	6	161576	161581	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319301
3586	NC_008340	TCG	2	6	161590	161595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319301
3587	NC_008340	GCC	2	6	161602	161607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319301
3588	NC_008340	GGGC	2	8	161617	161624	0 %	0 %	75 %	25 %	114319301
3589	NC_008340	CGGCCT	2	12	161701	161712	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	114319302
3590	NC_008340	ACC	2	6	161745	161750	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319302
3591	NC_008340	GCG	2	6	161754	161759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319302
3592	NC_008340	CCCG	2	8	161764	161771	0 %	0 %	25 %	75 %	114319302
3593	NC_008340	CAG	2	6	161774	161779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319302
3594	NC_008340	TGG	2	6	161818	161823	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319302
3595	NC_008340	CCAC	2	8	161832	161839	25 %	0 %	0 %	75 %	114319302
3596	NC_008340	CCA	2	6	161857	161862	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319302
3597	NC_008340	CGG	2	6	161865	161870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319302
3598	NC_008340	AGC	2	6	161886	161891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319302
3599	NC_008340	CGG	2	6	161923	161928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319302
3600	NC_008340	GCC	2	6	161933	161938	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319302
3601	NC_008340	GCTGT	2	10	161939	161948	0 %	40 %	40 %	20 %	114319302
3602	NC_008340	GTC	2	6	161954	161959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319302
3603	NC_008340	CGGC	2	8	161967	161974	0 %	0 %	50 %	50 %	114319302
3604	NC_008340	TAG	2	6	162024	162029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319302
3605	NC_008340	CCT	3	9	162058	162066	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114319302
3606	NC_008340	GAC	2	6	162068	162073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319302
3607	NC_008340	GCC	2	6	162077	162082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319302
3608	NC_008340	CTCG	2	8	162134	162141	0 %	25 %	25 %	50 %	114319302
3609	NC_008340	CAG	2	6	162161	162166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319302
3610	NC_008340	GGT	2	6	162205	162210	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319302
3611	NC_008340	AGC	3	9	162246	162254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319302
3612	NC_008340	GCGGTG	2	12	162261	162272	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	114319302
3613	NC_008340	GGT	2	6	162352	162357	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319302
3614	NC_008340	ACC	2	6	162399	162404	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319302
3615	NC_008340	GAA	2	6	162407	162412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114319302
3616	NC_008340	GGT	2	6	162430	162435	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319302
3617	NC_008340	CGG	2	6	162442	162447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319302
3618	NC_008340	ATC	2	6	162474	162479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319302
3619	NC_008340	GC	3	6	162492	162497	0 %	0 %	50 %	50 %	114319302
3620	NC_008340	GATGGC	2	12	162524	162535	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	114319302
3621	NC_008340	GCC	2	6	162547	162552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319302
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3623	NC_008340	GGC	2	6	162632	162637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319302
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3863	NC_008340	CCG	2	6	171134	171139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319309
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3983	NC_008340	CCA	2	6	176837	176842	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319315
3984	NC_008340	GCCG	2	8	176862	176869	0 %	0 %	50 %	50 %	114319315
3985	NC_008340	GGC	2	6	177007	177012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319315
3986	NC_008340	ACCG	2	8	177066	177073	25 %	0 %	25 %	50 %	114319315
3987	NC_008340	TGG	2	6	177115	177120	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319315
3988	NC_008340	CTG	2	6	177183	177188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319315
3989	NC_008340	CGG	2	6	177280	177285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319315
3990	NC_008340	CGA	3	9	177323	177331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319315
3991	NC_008340	GGCGAT	2	12	177339	177350	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	114319315
3992	NC_008340	GGCGGG	2	12	177351	177362	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	114319315
3993	NC_008340	CGG	2	6	177377	177382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319315
3994	NC_008340	GC	3	6	177417	177422	0 %	0 %	50 %	50 %	114319315
3995	NC_008340	GAC	2	6	177447	177452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319315
3996	NC_008340	CGC	2	6	177461	177466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319315
3997	NC_008340	CTG	2	6	177468	177473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319315
3998	NC_008340	CGC	2	6	177484	177489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319315
3999	NC_008340	GTG	2	6	177531	177536	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319315
4000	NC_008340	GGC	2	6	177537	177542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319315

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